Den danske Lidl-Trek-rytteren endte på en beskjeden sjetteplass på den 4. etappen. Ben Turner fra Ineos Grenadiers vant etappen.
Etter en andreplass på gårsdagens 3. etappe, skulle Mads Pedersen prøve å ta revansje på tirsdag på den 4. etappen, som endte litt oppover.
Men dansken mistet ledertoget sitt på de siste kilometerne og hadde langt fra optimale forhold for spurt.
Mads Pedersen endte derfor på en beskjeden sjetteplass, mens Ineos-rytter Ben Turner tok seieren.
Jonas Vingegaard mistt også ledertrøya, men har samme tid som David Gaudu (Groupama), som tar over den røde trøya. Franskmannen er den nye ledende rytteren, ettersom han har bedre etappeplasseringer over de fire første etappene til sammen.
– Det er greit. Det viktigste var at vi kom oss bra gjennom og at jeg ikke tapte noe tid. Jeg ligger fortsatt på samme tid som Gaudu og foran alle andre, sier Jonas Vingegaard til TV 2 Sport.
Det var hele 206 kilometer på menyen med flere fjell i starten av etappen. Det var imidlertid et altfor langt mål for sprinterne til å la seg skremme.
Det endte derfor i en forventet massespurt, som ble vanskeliggjort av mange skarpe svinger i oppkjøringen.
Det var i de mange svingene at Mads Pedersen mistet lagkameratene Søren Kragh Andersen og Daan Hoole, som burde ha levert ham til førsteplass.
I stedet skled Mads Pedersen inn i feltet, og da dansken skulle til å sette i gang spurten, var han for langt bak.
Det endte dermed med sjetteplass og en ny skuffelse for Lidl-Trek-laget, som jaktet etappeseire både i går og i dag.
– Målgangen var vanskelig og vrien, og jeg trenger en mann til å holde meg foran. Med 500 meter igjen må jeg holde munn, og jeg kunne trengt en mann foran meg. Jeg kommer sterkt inn på slutten, men det kan være det samme når man kjemper om femteplassen, forteller den tidligere verdensmesteren til TV2 Sport.
Mads Pedersen kan imidlertid være fornøyd med at han skrapte sammen nok poeng til å overta poengtrøya, som Jonas Vingegaard vant på mandag.
Nå kan den danske Visma-rytteren i stedet bruke den gule lagtrøya igjen. Han måtte ha endt maksimalt åtte plasser bak Gaudu for å beholde trøya. Men franskmannen endte på 25. plass, og Vingegaard på 42. plass.
Den to ganger Tour de France-vinneren kan ta tilbake trøya i morgen, når en 24 kilometer lang lagtempo i Vueltaen venter.